Dockerfile

FROM nvidia/cuda:10.0-devel-ubuntu18.04

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# Temporary Installation Directory
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ENV STAGE_DIR=/tmp
RUN mkdir -p ${STAGE_DIR}

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# Installation/Basic Utilities
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RUN apt-get update && \
        apt-get install -y --no-install-recommends \
        software-properties-common build-essential autotools-dev \
        nfs-common pdsh \
        cmake g++ gcc \
        curl wget vim tmux emacs less unzip \
        htop iftop iotop ca-certificates openssh-client openssh-server \
        rsync iputils-ping net-tools sudo \
        llvm-9-dev

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# Installation Latest Git
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RUN add-apt-repository ppa:git-core/ppa -y && \
        apt-get update && \
        apt-get install -y git && \
        git --version

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# Client Liveness & Uncomment Port 22 for SSH Daemon
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# Keep SSH client alive from server side
RUN echo "ClientAliveInterval 30" >> /etc/ssh/sshd_config
RUN cp /etc/ssh/sshd_config ${STAGE_DIR}/sshd_config && \
        sed "0,/^#Port 22/s//Port 22/" ${STAGE_DIR}/sshd_config > /etc/ssh/sshd_config

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# Mellanox OFED
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ENV MLNX_OFED_VERSION=4.6-1.0.1.1
RUN apt-get install -y libnuma-dev
RUN cd ${STAGE_DIR} && \
        wget -q -O - http://www.mellanox.com/downloads/ofed/MLNX_OFED-${MLNX_OFED_VERSION}/MLNX_OFED_LINUX-${MLNX_OFED_VERSION}-ubuntu18.04-x86_64.tgz | tar xzf - && \
        cd MLNX_OFED_LINUX-${MLNX_OFED_VERSION}-ubuntu18.04-x86_64 && \
        ./mlnxofedinstall --user-space-only --without-fw-update --all -q && \
        cd ${STAGE_DIR} && \
        rm -rf ${STAGE_DIR}/MLNX_OFED_LINUX-${MLNX_OFED_VERSION}-ubuntu18.04-x86_64*

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# nv_peer_mem
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ENV NV_PEER_MEM_VERSION=1.1
ENV NV_PEER_MEM_TAG=1.1-0
RUN mkdir -p ${STAGE_DIR} && \
        git clone https://github.com/Mellanox/nv_peer_memory.git --branch ${NV_PEER_MEM_TAG} ${STAGE_DIR}/nv_peer_memory && \
        cd ${STAGE_DIR}/nv_peer_memory && \
        ./build_module.sh && \
        cd ${STAGE_DIR} && \
        tar xzf ${STAGE_DIR}/nvidia-peer-memory_${NV_PEER_MEM_VERSION}.orig.tar.gz && \
        cd ${STAGE_DIR}/nvidia-peer-memory-${NV_PEER_MEM_VERSION} && \
        apt-get update && \
        apt-get install -y dkms && \
        dpkg-buildpackage -us -uc && \
        dpkg -i ${STAGE_DIR}/nvidia-peer-memory_${NV_PEER_MEM_TAG}_all.deb

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# OPENMPI
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ENV OPENMPI_BASEVERSION=4.0
ENV OPENMPI_VERSION=${OPENMPI_BASEVERSION}.1
RUN cd ${STAGE_DIR} && \
        wget -q -O - https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v${OPENMPI_BASEVERSION}/openmpi-${OPENMPI_VERSION}.tar.gz | tar xzf - && \
        cd openmpi-${OPENMPI_VERSION} && \
        ./configure --prefix=/usr/local/openmpi-${OPENMPI_VERSION} && \
        make -j"$(nproc)" install && \
        ln -s /usr/local/openmpi-${OPENMPI_VERSION} /usr/local/mpi && \
        # Sanity check:
        test -f /usr/local/mpi/bin/mpic++ && \
        cd ${STAGE_DIR} && \
        rm -r ${STAGE_DIR}/openmpi-${OPENMPI_VERSION}
ENV PATH=/usr/local/mpi/bin:${PATH} \
        LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib:/usr/local/mpi/lib:/usr/local/mpi/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}
# Create a wrapper for OpenMPI to allow running as root by default
RUN mv /usr/local/mpi/bin/mpirun /usr/local/mpi/bin/mpirun.real && \
        echo '#!/bin/bash' > /usr/local/mpi/bin/mpirun && \
        echo 'mpirun.real --allow-run-as-root --prefix /usr/local/mpi "$@"' >> /usr/local/mpi/bin/mpirun && \
        chmod a+x /usr/local/mpi/bin/mpirun

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# Python
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ENV DEBIAN_FRONTEND=noninteractive
ENV PYTHON_VERSION=3
RUN apt-get install -y python3 python3-dev && \
        rm -f /usr/bin/python && \
        ln -s /usr/bin/python3 /usr/bin/python && \
        curl -O https://bootstrap.pypa.io/pip/3.6/get-pip.py && \
        python get-pip.py && \
        rm get-pip.py && \
        pip install --upgrade pip && \
        # Print python an pip version
        python -V && pip -V
RUN pip install pyyaml
RUN pip install ipython

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# TensorFlow
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ENV TENSORFLOW_VERSION=1.15.2
RUN pip install tensorflow-gpu==${TENSORFLOW_VERSION}

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# Some Packages
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RUN apt-get update && \
        apt-get install -y --no-install-recommends \
        libsndfile-dev \
        libcupti-dev \
        libjpeg-dev \
        libpng-dev \
        screen \
        libaio-dev
RUN pip install psutil \
        yappi \
        cffi \
        ipdb \
        pandas \
        matplotlib \
        py3nvml \
        pyarrow \
        graphviz \
        astor \
        boto3 \
        tqdm \
        sentencepiece \
        msgpack \
        requests \
        pandas \
        sphinx \
        sphinx_rtd_theme \
        scipy \
        numpy \
        sklearn \
        scikit-learn \
        nvidia-ml-py3 \
        mpi4py \
        cupy-cuda100

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## SSH daemon port inside container cannot conflict with host OS port
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ENV SSH_PORT=2222
RUN cat /etc/ssh/sshd_config > ${STAGE_DIR}/sshd_config && \
        sed "0,/^#Port 22/s//Port ${SSH_PORT}/" ${STAGE_DIR}/sshd_config > /etc/ssh/sshd_config

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# PyTorch
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ENV PYTORCH_VERSION=1.2.0
ENV TORCHVISION_VERSION=0.4.0
ENV TENSORBOARDX_VERSION=1.8
RUN pip install torch==${PYTORCH_VERSION}
RUN pip install torchvision==${TORCHVISION_VERSION}
RUN pip install tensorboardX==${TENSORBOARDX_VERSION}

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# PyYAML build issue
# https://stackoverflow.com/a/53926898
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RUN rm -rf /usr/lib/python3/dist-packages/yaml && \
        rm -rf /usr/lib/python3/dist-packages/PyYAML-*

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## Add deepspeed user
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# Add a deepspeed user with user id 8877
#RUN useradd --create-home --uid 8877 deepspeed
RUN useradd --create-home --uid 1000 --shell /bin/bash deepspeed
RUN usermod -aG sudo deepspeed
RUN echo "deepspeed ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL" >> /etc/sudoers
# # Change to non-root privilege
USER deepspeed

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# DeepSpeed
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RUN git clone https://github.com/microsoft/DeepSpeed.git ${STAGE_DIR}/DeepSpeed
RUN cd ${STAGE_DIR}/DeepSpeed && \
        git checkout . && \
        git checkout master && \
        ./install.sh --pip_sudo
RUN rm -rf ${STAGE_DIR}/DeepSpeed
RUN python -c "import deepspeed; print(deepspeed.__version__)"