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Commit 0155d3db authored by zhuwenwen's avatar zhuwenwen
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...@@ -61,6 +61,8 @@ docker run -it --name proteinmpnn --shm-size=32G --device=/dev/kfd --device=/de ...@@ -61,6 +61,8 @@ docker run -it --name proteinmpnn --shm-size=32G --device=/dev/kfd --device=/de
./submit_example_2.sh ./submit_example_2.sh
## result ## result
\```
training/ training/
exp_020/ exp_020/
model_weights/ model_weights/
...@@ -79,13 +81,15 @@ outputs/ ...@@ -79,13 +81,15 @@ outputs/
assigned_pdbs.jsonl assigned_pdbs.jsonl
parsed_pdbs.jsonl parsed_pdbs.jsonl
\```
## 精度 ## 精度
测试数据：`/opt/ProteinMPNN-main/inputs`，使用的加速卡:1张 DCU Z100L-32G 测试数据：`/opt/ProteinMPNN-main/inputs`，使用的加速卡:1张 DCU Z100L-32G
准确率数据： 准确率数据：
| batch size | 数据类型 | 序列类型 | 序列标签 | 序列长度 | Sequence recovery(%) | | batch size | 数据类型 | 序列类型 | 序列标签 | 序列长度 | Sequence recovery(%) |
| :------: | :------: | :------: |:------: |:------: |:------: | | :------: | :------: | :------: |:------: |:------: |:------: |
| 1 | fp32 | 单体 | 5L33 | 106 | 39.6 | | 1 | fp32 | 单体 | 5L33 | 106 | 39.6 |
| 1 | fp32 | 单体 | 6MRR | 68 | 39.7 | | 1 | fp32 | 单体 | 6MRR | 68 | 39.7 |
| 1 | fp32 | 多体 | 3HTN | 429 | 55.7 | | 1 | fp32 | 多体 | 3HTN | 429 | 55.7 |
| 1 | fp32 | 多体 | 4YOW | 693 | 57.7 | | 1 | fp32 | 多体 | 4YOW | 693 | 57.7 |
......
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