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@@ -21,22 +21,24 @@ FastFold通过搜索同源序列和模板进行特征构造，基于蛋白质结
 ## 环境配置
 提供[光源](https://www.sourcefind.cn/#/service-details)拉取推理的docker镜像：
 ```
-docker pull image.sourcefind.cn:5000/dcu/admin/base/custom:fastfold-0.2.0-dtk23.10-v2
+docker pull image.sourcefind.cn:5000/dcu/admin/base/custom:fastfold-torch2.1.0-dtk24.04-centos7.6
 # <Image ID>用上面拉取docker镜像的ID替换
 # <Host Path>主机端路径
 # <Container Path>容器映射路径
-docker run -it --name fastfold --privileged --shm-size=32G  --device=/dev/kfd --device=/dev/dri/ --cap-add=SYS_PTRACE --security-opt seccomp=unconfined --ulimit memlock=-1:-1 --ipc=host --network host --group-add video -v <Host Path>:<Container Path> <Image ID> /bin/bash
+docker run -it -d --name fastfold --device=/dev/kfd --privileged --network=host --device=/dev/dri --cap-add=SYS_PTRACE --security-opt seccomp=unconfined -v /opt/hyhal:/opt/hyhal:ro -v /usr/local/hyhal:/usr/local/hyhal:ro --group-add video --shm-size 32G -v <Host Path>:<Container Path> <Image ID>
 ```
 
 镜像版本依赖：
-* DTK驱动：dtk23.10
-* Pytorch: 1.13
-* fastfold: 0.2.0
-* python: python3.8
+* DTK驱动：dtk24.04
+* Pytorch: 2.1.0
+* fastfold: 0.2.1
+* python: python3.10
 
+激活镜像环境：
+`source /home/env.sh`
 
 测试目录：
-`/opt/docker/tests`
+`/home/fastfold_pytorch`
 
 ## 数据集
 推荐使用AlphaFold2中的开源数据集，包括BFD、MGnify、PDB70、Uniclust、Uniref90等,数据集大小约3TB。数据集格式如下：
@@ -93,16 +95,16 @@ $DOWNLOAD_DIR/
 
 ### 单体
 
-    python inference.py T1024.fasta data/pdb_mmcif/mmcif_files/ \
-    --output_dir ./ \
-    --gpus 1 \
-    --use_precomputed_alignments alignments/ \
+    python inference.py T1024.fasta /data/pdb_mmcif/mmcif_files/ \
+    --output_dir ./output \
+    --gpus 4 \
+    --use_precomputed_alignments data/alignments/ \
     --param_path /data/params/params_model_1.npz  \
-    --uniref90_database_path data/uniref90/uniref90.fasta \
-    --mgnify_database_path data/mgnify/mgy_clusters_2018_12.fa \
-    --pdb70_database_path data/pdb70/pdb70 \
-    --uniclust30_database_path data/uniclust30/uniclust30_2018_08/uniclust30_2018_08 \
-    --bfd_database_path data/bfd/bfd_metaclust_clu_complete_id30_c90_final_seq.sorted_opt \
+    --uniref90_database_path /data/uniref90/uniref90.fasta \
+    --mgnify_database_path /data/mgnify/mgy_clusters_2018_12.fa \
+    --pdb70_database_path /data/pdb70/pdb70 \
+    --uniclust30_database_path /data/uniclust30/uniclust30_2018_08/uniclust30_2018_08 \
+    --bfd_database_path /data/bfd/bfd_metaclust_clu_complete_id30_c90_final_seq.sorted_opt \
     --jackhmmer_binary_path `which jackhmmer` \
     --hhblits_binary_path `which hhblits` \
     --hhsearch_binary_path `which hhsearch` \
@@ -110,7 +112,7 @@ $DOWNLOAD_DIR/
     --chunk_size 4 \
     --inplace
 
-或者使用`./inference.sh`
+或者使用`sh inference.sh`
 
 #### 单体推理参数说明
 T1024.fasta为推理的单体序列；data修改为数据集下载目录；