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README.md

-# DeePMD(Deep Potential Molecular Dynamics)
-## 模型介绍
+# DeePMD
+## 论文
+参考End-to-end Symmetry Preserving Inter-atomic Potential Energy Model for Finite and Extended Systems
 
-DeePMD-kit是深度势能分子动力学的开源项目。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动。分子动力学在微观世界模拟中起着承载作用，在物理、化学、生物、材料科学以及力学等领域都有着非常重要的应用。
+## 模型结构
+DeePMD-kit是深度势能分子动力学的开源项目。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动。分子动力学在微观世界模拟中起着承载作用，在物理、化学、生物、材料科>学以及力学等领域都有着非常重要的应用。
 
 深势科技成功将DeePMD-kit进行了并行化，首次实现了具有AIMD精度的第一性原理分子动力学模拟的商业与原子规模的应用，为分子动力学提供了革命性的高性能解决方案。
+![DeePMD_Backbone](DeePMD_Backbone.png)
 
-## 模型结构
+## 算法原理
+DeePMD-kit使用第一性原理计算的输入、输出结果来训练模型。
+模型输入：原子坐标x, y, z和元素种类；
+模型输出：体系能量，能量对坐标的一阶导数值（原子受力）；
 
-DeePMD-Kit,参考https://docs.deepmodeling.com/projects/deepmd/en/master/index.html
+1、首先根据原子坐标和种类生成矩阵，矩阵可在旋转和平移的情况下保持不变，以保证第一性原理的计算结果不变；
+2、将矩阵输入一个多层全连接网络（fitting net），得到该体系中单个原子的能量，求和即可得到体系总能量；
+3、体系总能量对原子坐标求一阶导，一阶导对应原子受力；
+4、将模型输出结果（能量+原子受力）输入分子动力学模拟软件LAMMPS中求解动力学结果；
+
+## 环境配置
+### Docker(方法一)
+提供[光源](https://www.sourcefind.cn/#/service-details)拉取的训练的docker镜像：
 
-## DeePMD代码参考版本
+训练镜像：
+```
+  docker pull image.sourcefind.cn:5000/dcu/admin/base/custom:deepmd
+```
+激活镜像环境及运行测试
+```
+  source /root/env_disc.sh
 
-版本：v2.1.5
+  cd /root/test_case/water
 
-原始代码位置：https://github.com/deepmodeling/deepmd-kit
+  sh run.sh
+```
+python依赖安装：
 
+```
+  pip3 install -r requirement.txt
+```
 ## 数据集
 
 示例中验证的数据集来自：
@@ -29,26 +53,6 @@ tar -xvf data.tar.gz
 
 ## 训练
 
-### 环境配置
-提供[光源](https://www.sourcefind.cn/#/service-details)拉取的训练的docker镜像：
-
-* 训练镜像：
-```
-  docker pull image.sourcefind.cn:5000/dcu/admin/base/custom:deepmd
-```
-* 激活镜像环境及运行测试
-```
-  source /root/env_disc.sh
-
-  cd /root/test_case/water
- 
-  sh run.sh
-```
-* python依赖安装：
-
-```
-  pip3 install -r requirement.txt
-```
 ### 安装(如使用镜像，则无需再次安装)
 ```
 export ROCM_ROOT=/opt/dtk-22.04.2
@@ -65,11 +69,12 @@ DP_VARIANT=rocm  python3 -m pip install .  -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/
 ```
     disc.enable()
 ```
+
 ## 源码仓库及问题反馈
 
-* https://developer.hpccube.com/codes/modelzoo/bladedisc_deepmd
+https://developer.hpccube.com/codes/modelzoo/bladedisc_deepmd
 
 ## 参考
 
-* https://github.com/deepmodeling/deepmd-kit 
+https://github.com/deepmodeling/deepmd-kit 
 

model.properties

+# 模型唯一标识
+modelCode=134
 # 模型名称
-modelName=DeePMD_BladeDISC
+modelName=DeePMD_bladedisc
 # 模型描述
 modelDescription=DeePMD是深度势能分子动力学的开源项目,基于BladeDISC进行深度学习编译优化
 # 应用场景(多个标签以英文逗号分割)