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@@ -40,7 +40,37 @@ docker run -it --name alphafold --shm-size=32G  --device=/dev/kfd --device=/dev/
 `/opt/docker/tests/alphafold`
 
 ## 数据集
-推荐使用AlphaFold2中的开源数据集，包括BFD、MGnify、PDB70、Uniclust、Uniref90等,数据集大小约3TB。
+推荐使用AlphaFold2中的开源数据集，包括BFD、MGnify、PDB70、Uniclust、Uniref90等,数据集大小约3TB。数据集格式如下：
+```
+$DOWNLOAD_DIR/                             # Total: ~ 2.2 TB (download: 438 GB)
+    bfd/                                   # ~ 1.7 TB (download: 271.6 GB)
+        # 6 files.
+    mgnify/                                # ~ 64 GB (download: 32.9 GB)
+        mgy_clusters_2018_12.fa
+    params/                                # ~ 3.5 GB (download: 3.5 GB)
+        # 5 CASP14 models,
+        # 5 pTM models,
+        # 5 AlphaFold-Multimer models,
+        # LICENSE,
+        # = 16 files.
+    pdb70/                                 # ~ 56 GB (download: 19.5 GB)
+        # 9 files.
+    pdb_mmcif/                             # ~ 206 GB (download: 46 GB)
+        mmcif_files/
+            # About 180,000 .cif files.
+        obsolete.dat
+    pdb_seqres/                            # ~ 0.2 GB (download: 0.2 GB)
+        pdb_seqres.txt
+    small_bfd/                             # ~ 17 GB (download: 9.6 GB)
+        bfd-first_non_consensus_sequences.fasta
+    uniclust30/                            # ~ 86 GB (download: 24.9 GB)
+        uniclust30_2018_08/
+            # 13 files.
+    uniprot/                               # ~ 98.3 GB (download: 49 GB)
+        uniprot.fasta
+    uniref90/                              # ~ 58 GB (download: 29.7 GB)
+        uniref90.fasta
+```
 
 此处提供了一个脚本download_all_data.sh用于下载使用的数据集和模型文件：
 
@@ -115,7 +145,7 @@ multimer.fasta为推理的多体序列，data为数据集下载路径，其他
 
 1、计算lddt的值
 
-    python3 run_alphafold.py
+    python3 pkl2plddt.py
     其中，data_path为推理生成的pkl文件路径。