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README.md

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 安装FastFold,你需要
 + Python 3.8 或者 3.9.
 
-### 使用pip安装
+### 使用pip方式安装
 fastfold whl包下载目录：[https://cancon.hpccube.com:65024/4/main/fastfold/dtk23.04](https://cancon.hpccube.com:65024/4/main/fastfold/dtk23.04)
 根据对应的pytorch版本和python版本，下载对应fastfold的whl包
 
@@ -12,47 +12,42 @@ fastfold whl包下载目录：[https://cancon.hpccube.com:65024/4/main/fastfold/
 pip install fastfold* (下载的fastfold的whl包)
 ```
 
-### 使用源码安装
+### 使用源码编译方式安装
 
 #### 编译环境准备
-pytorch whl包下载目录：[https://cancon.hpccube.com:65024/4/main/pytorch/dtk23.04](https://cancon.hpccube.com:65024/4/main/pytorch/dtk23.04)
-根据python版本,下载对应pytorch的whl包
+提供2种环境准备方式：
+
+1. 基于光源pytorch基础镜像环境：镜像下载地址：[https://sourcefind.cn/#/image/dcu/pytorch](https://sourcefind.cn/#/image/dcu/pytorch)，根据pytorch、python、dtk及系统下载对应的镜像版本。
+
+2. 基于现有python环境：安装pytorch，pytorch whl包下载目录：[https://cancon.hpccube.com:65024/4/main/pytorch/dtk23.04](https://cancon.hpccube.com:65024/4/main/pytorch/dtk23.04)，根据python、dtk版本,下载对应pytorch的whl包。安装命令如下：
 ```shell
 pip install torch* (下载的torch的whl包)
+pip install setuptools==59.5.0 wheel
 ```
 
+#### 源码编译安装
+- 代码下载
 ```shell
-pip install setuptools=59.5.0 wheel
+git clone https://developer.hpccube.com/codes/aicomponent/fastfold  # 根据需要的分支进行切换
 ```
 
-#### 编译安装
-```shell
-git clone https://developer.hpccube.com/codes/aicomponent/fastfold  # 根据需要的分支进行切换
-cd fastfold
+- 提供2种源码编译方式（进入fastfold目录）：
+```
+1. 编译whl包并安装
 export CPLUS_INCLUDE_PATH=$ROCM_PATH/include:$ROCM_PATH/cuda/targets/x86_64-linux/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH
-
-1、 编译whl包并安装
-python setup.py bdist_wheel  
+python setup.py bdist_wheel 
 pip install dist/fastfold*
 
-2、 直接编译安装
-python setup.py install 
+2. 源码编译安装
+export CPLUS_INCLUDE_PATH=$ROCM_PATH/include:$ROCM_PATH/cuda/targets/x86_64-linux/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH
+python3 setup.py install 
 ```
 
-## 安装包命名
-例： fastfold-0.2.1+git9f6252f.abi0.dtk2304.torch1.10-cp38-cp38-manylinux2014_x86_64.whl
-- fastfold: 安装包名称；
-- 0.2.1: 安装包版本号；
-- git9f6252f: git号；
-- abi0: 对应centos和rocky多系统的标识，取值为abi0（centos7），abi1(rocky8)，可使用命令行动态查询获取辅助判断（echo '#include <string>' | gcc -x c++ -E -dM - | fgrep _GLIBCXX_USE_CXX11_ABI）;
-- dtk2304: 对应dtk大版本号，命令行动态查询取值（/opt/dtk-23.04/.info/rocm_version）；
-- torch1.10: 对应构建的torch版本号，命令行动态查询取值（torch.\_\_version__）;
-- cp38-cp38: 对应python版本号；
-- manylinux2014_x86_64: 系统架构；
-
 ## 版本号查询
-- fastfold.\_\_version__：与官方版本同步，查询该安装包的版本号，例如0.2.1（基于官方0.2.0修改）；
+- python -c "import fastfold; print(fastfold.\_\_version__)"，版本号与官方版本同步，查询该软件的版本号，例如0.2.0；
 
+## Known Issue
+- 无
 
 ## Note
 + 若使用 pip install 下载安装过慢，可添加源：-i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/